常见问题解答
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Q:
合成dsRNA转染后细胞毒性大、死亡多是什么原因?
A:dsRNA不纯,包括转录副产物、残留DNA或者酶都有可能引起;如果是双端转录合成,产生的副产物会比单端转录的副产物多,单端转录主要是截短 RNA、异常折叠的单链 RNA,双端转录除截短产物外,大量全长 / 部分长度互补双链 RNA,是最主要副产物,双端转录建议换成单端转录,分别合成互补ssRNA后再退火成dsRNA。
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Q:
dsRNA合成推荐Protocol
A:https://cshprotocols.cshlp.org/content/2019/3/pdb.prot097469.full
10×退火Buffer: 200 mM Tris-HCl,750 mM KCl pH 7.5@25℃ -
Q:
核酸染料凝胶内染色的常见问题是什么原因?有什么解决办法?
A:核酸染料凝胶内染色的常见问题:1. DNA Marker拖带、条带分离不开,2. 样品条带与DNA Marker出现大小不一致。
其根本原因是:目前使用的大多数无毒染料都是大分子量染料。与核酸结合的染料会改变样品的分子量大小, 造成凝胶迁移,导致样品的大小与实际不符。
DNA Ladder中分子量较小的片段迁移速率快,先结合染料,率先到达饱和。较大的片段迁移率慢,需要更长时间才能达到饱和。在这个过程中造成的分子量偏差和较大片段分离不开,是事实存在的。
推荐解决方案:1. 降低Marker上样量,2. 电泳后泡染法染胶。 -
Q:
Marker跑不开是什么原因?
A:1. 胶浓度不合适,根据实际情况推荐合适制胶浓度。
2. 核酸染料胶内染料,Marker上样量过高或者电泳时间短。核酸染料胶内染胶推荐Marker上样量窄孔1 μl,宽孔2 μl,如果搭配我司核酸染料需电泳电压控制在4~6 V/cm(总电压=4~6×电泳槽正负极之间的长度)电泳。 -
Q:
Safe Green这款染料是蓝光完全激发,为什么紫外照出来要比蓝光更亮?
A:Green在紫外激发下比蓝光照胶更亮可能有以下几个因素:
1. 紫外光源功率远高于蓝光,单位时间激发效率悬殊荧光信号的初始强度与激发光功率直接相关。若紫外光源(如 254 nm 或 302 nm 透射仪)的实际输出功率远高于蓝光光源(如 488 nm 激发灯),即使紫外仅曝光 3 秒,其单位时间内激发的染料荧光量可能是蓝光的 10 倍以上。
2. 成像系统对紫外激发的荧光检测效率更高:若成像系统的滤光片、CCD 传感器对紫外激发后染料的发射光(约 520~540 nm)更敏感,即使紫外激发的荧光总量与蓝光接近,检测到的信号也会更强。
3. Green 的荧光可能在蓝光激发下更易发生淬灭(如染料浓度过高时,分子间相互作用导致蓝光激发的荧光衰减更快),而紫外光的高能量激发可能减少淬灭效应(或淬灭阈值更高)。检查实验中的染料使用浓度是否较高。 -
Q:
为什么同一块胶电泳上部分的条带会比下部分的条带要亮?
A:如果是核酸染料加在胶里面:绝大多数核酸染料带正电;DNA 带负电,电泳时向正极(下方)跑,染料往负极(上方)反向迁移。上部分胶长期处在染料浓度充足的胶上部区域,持续结合染料,条带偏亮;下部分胶由于染料往上方迁移,小片段往下方迁移,结合染料浓度低,两者背道而驰,导致最终下部分胶小片段明显偏暗。一整块胶上下区域一起跑,电泳时间越长,这个现象越严重。建议小片段缩短电泳时间电泳。
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Q:
胶原酶性状
A:外观:灰色固体粉末(偏深棕色)。
溶解外观:100mg/ml 深褐色溶液,会有少量沉淀。沉淀并不会影响溶液的活性。本品为粗提品,溶液会有少量沉淀属于正常现象。 -
Q:
胶原酶配制溶液后-20℃可以保存多久?
A:用含钙镁HBSS溶解,-20℃ 1个月内可以用,暂无更长数据;
建议分装后单次使用不复冻,避免反复冻融,冻融影响活性。 -
Q:
胶原酶稳定性如何?
A:未吸潮情况下,冻干粉5度可以放3年活性不下降。
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Q:
胶原酶I、II、IV型的区别?
A:I型:胶原酶≥125 U/mg,酪蛋白酶≥200 U/mg,梭菌蛋白酶≤4.0 U/mg,胰蛋白酶≤0.5 U/mg,适用于上皮、肝、肺、脂肪和肾上腺等组织和细胞的解离。
II型:胶原酶≥125 U/mg,酪蛋白酶≥200 U/mg,梭菌蛋白酶≥3.5 U/mg,胰蛋白酶≥0.1 U/mg,更高的蛋白酶活性,适用于心脏、甲状腺、唾液腺、肝、骨、软骨等组织和细胞的解离。
IV型:胶原酶≥160 U/mg,酪蛋白酶≥100 U/mg,梭菌蛋白酶≤3.0 U/mg,胰蛋白酶≤0.1 U/mg,低蛋白酶活性,适用于胰岛细胞制备。
