在中等水平（0.5~1.0%离子和非离子去污剂）下，大多数糖苷酶显示出令人满意的活性或不受影响。例外情况是：PNGase F（所有产品）、O-糖苷酶和β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶，它们会被SDS抑制。必须将NP-40添加到反应混合物中，使最终浓度为1%，以抵消去污剂的抑制。
常见的稳定试剂，如 吐温、Triton X-100、NP-40、辛基葡萄糖苷和非去垢剂磺基甜菜碱，以及痕量有机溶剂，可以阻止 PNGase F 对糖基又好又快的释放。

糖苷酶用于获取与糖蛋白和糖肽相连的糖基的信息。它们有两种类型，内切糖苷酶和外切糖苷酶。内切糖苷酶可以将整个糖基从蛋白质上切下来，而外切糖苷酶则从糖的非还原端去除单糖。还原端是指由内切糖苷酶产生的端。研究人员经常先使用内切糖苷酶，然后使用一种或多种外切糖苷酶，最后通过SDS-PAGE或各种类型的液相色谱分析产物。

糖苷酶可以在温和的条件下去除糖基，保持肽键的完整性。酶也可以在天然条件下用于折叠的蛋白质，尽管由于空间位阻和其他限制，它们的作用效率可能较低。

是正常现象，其主要组分是Na3PO4，低温会析出，解冻后恢复室温涡旋会复溶。

下游进行SDS-PAGE 、Western blot、常规生物酶活验证可选择有甘油版；下游进行质谱、HPLC、糖链分析选择无甘油版本。

(1) 电压过高或电泳时间过长，产热过多导致电泳缓冲液温度升高。
(2) 电泳缓冲液陈旧，建议使用新鲜的电泳缓冲液。
(3) 分离胶的浓度偏低，建议使用合适的胶浓度。
(4) 凝胶放置时间过长，建议使用新配制的凝胶电泳。

(1) 建议点样时将蛋白Marker放在泳道中间。如在凝胶两侧泳道，由于边缘效应、离子强度不均等原因，均会导致带型变宽或弯曲。
(2) 凝胶配制不均匀，凝胶内存有气泡，或点样孔中有细碎的残胶。

这种是正常情况。预染 Marker 因为染料修饰，迁移率本身就会随胶体系变化；不同厂商标定体系、蛋白分子量会存在差异；如果要精确定量分子大小请选择非预染蛋白Marker。

大多为胶浓度不合适，要在推荐的凝胶浓度范围内使用。

(1) 转膜时一定要将胶和膜压紧，否则条带会在转膜过程中丢失或变浅。
(2) 转膜条件不合适：大分子蛋白难转，需要延长转膜时间；小分子容易转穿膜。
(3) 转膜缓冲液甲醇浓度过高（>20%），会让蛋白沉淀或者蛋白穿膜；推荐 10–15% 甲醇。